Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLHC1Q8NHS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLHC1Q8NHS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.5 ms