Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6DQ8NFY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6DQ8NFY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms