Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37AQ8NEZ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS37AQ8NEZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms