Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP1BQ659C4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LARP1BQ659C4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms