Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BNIP1Q12981 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP1Q12981 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP1Q12981 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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