Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 FZF1YGL254W 900 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 KSH1YNL024C-A 219 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SEC62YPL094C 825 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 DUG1YFR044C 1446 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 NUP49YGL172W 1419 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 RMD9YGL107C 1941 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 COQ1YBR003W 1422 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 MIA40YKL195W 1212 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 RPR1RPR1 369 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 LSG1YGL099W 1923 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 GFA1YKL104C 2154 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 HEM1YDR232W 1647 nt5.52□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 RIX7YLL034C 2514 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 PPH21YDL134C 1110 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 AGX1YFL030W 1158 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 RFC4YOL094C 972 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YBR113WYBR113W 483 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YBR124WYBR124W 360 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YFR006WYFR006W 1608 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 PRY3YJL078C 2646 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 HDA1YNL021W 2121 nt5.51□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 STT3YGL022W 2157 nt5.5□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YOL046CYOL046C 675 nt5.5□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 CWC27YPL064C 906 nt5.5□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.5□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 BZZ1YHR114W 1902 nt5.49□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 AIM33YML087C 939 nt5.49□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 SES1YDR023W 1389 nt5.49□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YKR023WYKR023W 1593 nt5.49□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YHK8YHR048W 1545 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 PMT3YOR321W 2262 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 FBA1YKL060C 1080 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 DFR1YOR236W 636 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 ASR1YPR093C 867 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 PEX3YDR329C 1326 nt5.48□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 YJR154WYJR154W 1041 nt5.47□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 RNH1YMR234W 1047 nt5.47□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 LGE1YPL055C 999 nt5.47□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 DOT1YDR440W 1749 nt5.47□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 EHD3YDR036C 1503 nt5.47□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 ATF1YOR377W 1578 nt5.46□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 COX15YER141W 1461 nt5.46□□□□□ -1.53
HRD1Q08109 THI2YBR240C 1353 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 RPP1YHR062C 882 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 HSP150YJL159W 1242 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YJR146WYJR146W 354 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 COX5AYNL052W 462 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MRP51YPL118W 1035 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 TEL2YGR099W 2067 nt5.46□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MIP1YOR330C 3765 nt5.45□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 NSE5YML023C 1671 nt5.45□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YNL092WYNL092W 1203 nt5.45□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 ZIM17YNL310C 525 nt5.45□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 EMW1YNL313C 2715 nt5.45□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YDR387CYDR387C 1668 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 TRP5YGL026C 2124 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YRB2YIL063C 984 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 SQT1YIR012W 1296 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 OGG1YML060W 1131 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YNL120CYNL120C 486 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 RUF23RUF23 254 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 CCC2YDR270W 3015 nt5.44□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 GEP5YLR091W 882 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YAR064WYAR064W 300 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 AAD14YNL331C 1131 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 ESC8YOL017W 2145 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MCP1YOR228C 909 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 ATP4YPL078C 735 nt5.43□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 UTR2YEL040W 1404 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 CRZ1YNL027W 2037 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 TIM22YDL217C 624 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 FAL1YDR021W 1200 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 HOC1YJR075W 1191 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YPL257WYPL257W 582 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 SPE3YPR069C 882 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MSY1YPL097W 1479 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YOL036WYOL036W 2286 nt5.42□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 KEL1YHR158C 3495 nt5.41□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 XBP1YIL101C 1944 nt5.41□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 GPB2YAL056W 2643 nt5.41□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 TKL1YPR074C 2043 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 IMA2YOL157C 1770 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 LYS1YIR034C 1122 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 LIA1YJR070C 978 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 AIM24YJR080C 1185 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 YKL077WYKL077W 1179 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MRPL23YOR150W 492 nt5.4□□□□□ -1.54
HRD1Q08109 MSS1YMR023C 1581 nt5.4□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 GEX1YCL073C 1848 nt5.39□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 GEX2YKR106W 1848 nt5.39□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 YMR279CYMR279C 1623 nt5.39□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 YLR123CYLR123C 330 nt5.39□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 FMP40YPL222W 2067 nt5.39□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 PPM1YDR435C 987 nt5.38□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 YKL102CYKL102C 306 nt5.38□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 RHO4YKR055W 876 nt5.38□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 JIP4YDR475C 2631 nt5.38□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 SCT1YBL011W 2280 nt5.37□□□□□ -1.55
HRD1Q08109 RNR3YIL066C 2610 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.5 ms