Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROM1Q03395 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ROM1Q03395 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ROM1Q03395 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ROM1Q03395 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ROM1Q03395 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROM1Q03395 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ROM1Q03395 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROM1Q03395 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROM1Q03395 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROM1Q03395 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROM1Q03395 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ROM1Q03395 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ROM1Q03395 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ROM1Q03395 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ROM1Q03395 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1044 ms