Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK6Q00534 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK6Q00534 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK6Q00534 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.7 ms