Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL38P63173 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL38P63173 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL38P63173 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL38P63173 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL38P63173 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL38P63173 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL38P63173 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL38P63173 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL38P63173 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL38P63173 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL38P63173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL38P63173 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL38P63173 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL38P63173 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL38P63173 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL38P63173 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL38P63173 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL38P63173 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL38P63173 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL38P63173 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL38P63173 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL38P63173 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL38P63173 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL38P63173 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL38P63173 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL38P63173 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL38P63173 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL38P63173 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL38P63173 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.6 ms