Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS3AP61247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms