Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS2P61201 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS2P61201 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS2P61201 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS2P61201 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS2P61201 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS2P61201 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS2P61201 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS2P61201 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS2P61201 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS2P61201 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS2P61201 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS2P61201 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS2P61201 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS2P61201 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS2P61201 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS2P61201 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS2P61201 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS2P61201 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS2P61201 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS2P61201 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS2P61201 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS2P61201 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS2P61201 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS2P61201 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS2P61201 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS2P61201 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS2P61201 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS2P61201 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS2P61201 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS2P61201 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS2P61201 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS2P61201 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS2P61201 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS2P61201 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS2P61201 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS2P61201 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS2P61201 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS2P61201 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS2P61201 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS2P61201 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS2P61201 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS2P61201 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS2P61201 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS2P61201 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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