Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3P61158 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR3P61158 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3P61158 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3P61158 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms