Protein–RNA interactions for Protein: P51970

NDUFA8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA8P51970 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFA8P51970 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFA8P51970 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFA8P51970 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFA8P51970 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFA8P51970 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFA8P51970 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFA8P51970 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFA8P51970 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NDUFA8P51970 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFA8P51970 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDUFA8P51970 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDUFA8P51970 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDUFA8P51970 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NDUFA8P51970 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NDUFA8P51970 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NDUFA8P51970 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDUFA8P51970 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDUFA8P51970 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NDUFA8P51970 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFA8P51970 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFA8P51970 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms