Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF6P23409 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF6P23409 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF6P23409 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF6P23409 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF6P23409 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF6P23409 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF6P23409 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF6P23409 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF6P23409 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF6P23409 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF6P23409 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF6P23409 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF6P23409 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF6P23409 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF6P23409 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF6P23409 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF6P23409 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF6P23409 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF6P23409 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYF6P23409 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYF6P23409 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYF6P23409 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYF6P23409 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYF6P23409 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYF6P23409 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYF6P23409 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYF6P23409 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYF6P23409 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYF6P23409 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYF6P23409 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYF6P23409 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYF6P23409 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYF6P23409 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYF6P23409 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms