Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC166P0CW27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC166P0CW27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC166P0CW27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms