Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP1O94782 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP1O94782 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP1O94782 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP1O94782 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP1O94782 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP1O94782 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP1O94782 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP1O94782 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP1O94782 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP1O94782 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP1O94782 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP1O94782 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP1O94782 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP1O94782 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP1O94782 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP1O94782 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP1O94782 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP1O94782 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP1O94782 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP1O94782 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP1O94782 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP1O94782 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP1O94782 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP1O94782 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP1O94782 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP1O94782 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP1O94782 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP1O94782 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP1O94782 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP1O94782 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP1O94782 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP1O94782 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP1O94782 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP1O94782 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP1O94782 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP1O94782 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP1O94782 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP1O94782 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP1O94782 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP1O94782 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP1O94782 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP1O94782 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms