Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOPO43791 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOPO43791 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOPO43791 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOPO43791 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOPO43791 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOPO43791 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOPO43791 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOPO43791 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOPO43791 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOPO43791 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOPO43791 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOPO43791 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOPO43791 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOPO43791 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOPO43791 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOPO43791 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOPO43791 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOPO43791 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOPO43791 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOPO43791 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOPO43791 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOPO43791 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOPO43791 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOPO43791 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOPO43791 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOPO43791 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOPO43791 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOPO43791 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOPO43791 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOPO43791 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOPO43791 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOPO43791 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOPO43791 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOPO43791 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOPO43791 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOPO43791 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOPO43791 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOPO43791 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPOPO43791 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPOPO43791 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPOPO43791 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOPO43791 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOPO43791 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOPO43791 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOPO43791 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms