Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHADO15335 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHADO15335 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHADO15335 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHADO15335 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHADO15335 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHADO15335 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHADO15335 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHADO15335 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHADO15335 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHADO15335 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHADO15335 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHADO15335 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHADO15335 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHADO15335 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHADO15335 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHADO15335 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHADO15335 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHADO15335 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHADO15335 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHADO15335 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHADO15335 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHADO15335 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHADO15335 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHADO15335 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHADO15335 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHADO15335 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHADO15335 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHADO15335 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHADO15335 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHADO15335 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHADO15335 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHADO15335 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHADO15335 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHADO15335 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHADO15335 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHADO15335 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHADO15335 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHADO15335 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHADO15335 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHADO15335 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHADO15335 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHADO15335 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHADO15335 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHADO15335 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHADO15335 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHADO15335 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms