Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A1O00337 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A1O00337 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms