Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAPO00193 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAPO00193 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAPO00193 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAPO00193 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAPO00193 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAPO00193 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAPO00193 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAPO00193 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAPO00193 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAPO00193 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAPO00193 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAPO00193 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAPO00193 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAPO00193 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAPO00193 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAPO00193 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAPO00193 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAPO00193 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAPO00193 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAPO00193 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAPO00193 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAPO00193 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAPO00193 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAPO00193 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAPO00193 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAPO00193 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAPO00193 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAPO00193 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAPO00193 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAPO00193 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAPO00193 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAPO00193 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAPO00193 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAPO00193 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAPO00193 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAPO00193 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAPO00193 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAPO00193 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAPO00193 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAPO00193 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAPO00193 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAPO00193 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAPO00193 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAPO00193 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAPO00193 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAPO00193 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAPO00193 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAPO00193 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAPO00193 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAPO00193 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAPO00193 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAPO00193 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAPO00193 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAPO00193 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAPO00193 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAPO00193 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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