Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NuggcD3YWJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NuggcD3YWJ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NuggcD3YWJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NuggcD3YWJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms