Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A0U1RQJ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms