Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A087X0T9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A087X0T9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A087X0T9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms