Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCQ9Y266 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCQ9Y266 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms