Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms