Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms