Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms