Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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