Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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