Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP26Q9NRE1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP26Q9NRE1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms