Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms