Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms