Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC17Q9NP64 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms