Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms