Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REPIN1Q9BWE0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms