Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRIP3Q9BW71 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms