Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms