Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2D-208ENST00000508738 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CPA2-201ENST00000222481 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 SLMAP-219ENST00000494088 1305 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM104B-201ENST00000332132 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NXNP1-201ENST00000397383 1051 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001116.1-201ENST00000421604 762 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099794.2-201ENST00000435230 303 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A22-AS1-201ENST00000444042 921 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MAJIN-204ENST00000530444 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092757.3-201ENST00000619686 543 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090061.1-202ENST00000502102 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms