Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5Q99717 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms