Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAT1Q99536 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms