Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF3RQ99062 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms