Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP400Q96L91 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms