Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRIQ1Q96JM4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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