Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VCPIP1Q96JH7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms