Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms