Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms