Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms