Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF3AQ92664 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms