Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB40AQ8WXH6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms