Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms